MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 chromosome 2

Total Repeats: 62652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010530	GCC	2	6	110	115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591848
2	NC_010530	CAT	2	6	160	165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591848
3	NC_010530	AAC	2	6	182	187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591848
4	NC_010530	TCCG	2	8	193	200	0 %	25 %	25 %	50 %	188591848
5	NC_010530	CGA	2	6	220	225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591848
6	NC_010530	GCG	2	6	261	266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591848
7	NC_010530	CG	3	6	314	319	0 %	0 %	50 %	50 %	188591848
8	NC_010530	GC	3	6	327	332	0 %	0 %	50 %	50 %	188591848
9	NC_010530	TGA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591848
10	NC_010530	GCA	2	6	394	399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591848
11	NC_010530	GC	3	6	409	414	0 %	0 %	50 %	50 %	188591848
12	NC_010530	CAG	2	6	659	664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591848
13	NC_010530	CGA	2	6	684	689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591848
14	NC_010530	CCAGAA	2	12	721	732	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	188591848
15	NC_010530	TCGA	2	8	752	759	25 %	25 %	25 %	25 %	188591848
16	NC_010530	CTG	2	6	773	778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591848
17	NC_010530	TGG	2	6	797	802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591848
18	NC_010530	GTG	2	6	845	850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591848
19	NC_010530	TTC	2	6	863	868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591848
20	NC_010530	GCCGGT	2	12	886	897	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	188591848
21	NC_010530	GC	4	8	904	911	0 %	0 %	50 %	50 %	188591848
22	NC_010530	CG	3	6	1058	1063	0 %	0 %	50 %	50 %	188591848
23	NC_010530	TGG	2	6	1092	1097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591848
24	NC_010530	CTTG	2	8	1336	1343	0 %	50 %	25 %	25 %	188591849
25	NC_010530	CAC	2	6	1426	1431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591849
26	NC_010530	CGT	2	6	1432	1437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591849
27	NC_010530	TAA	2	6	1444	1449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188591849
28	NC_010530	GCCA	2	8	1876	1883	25 %	0 %	25 %	50 %	188591850
29	NC_010530	ATC	2	6	1886	1891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591850
30	NC_010530	GAC	2	6	1924	1929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591850
31	NC_010530	GCAT	2	8	1935	1942	25 %	25 %	25 %	25 %	188591850
32	NC_010530	GGC	2	6	2020	2025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591850
33	NC_010530	CGA	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591850
34	NC_010530	TGG	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591850
35	NC_010530	TCG	2	6	2133	2138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591850
36	NC_010530	CCG	2	6	2147	2152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591850
37	NC_010530	CGG	2	6	2163	2168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591850
38	NC_010530	CAT	2	6	2203	2208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591850
39	NC_010530	CGT	2	6	2212	2217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591850
40	NC_010530	CGC	2	6	2223	2228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591850
41	NC_010530	GCT	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591850
42	NC_010530	CG	3	6	2341	2346	0 %	0 %	50 %	50 %	188591850
43	NC_010530	CGA	2	6	2368	2373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591850
44	NC_010530	GCT	2	6	2386	2391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591850
45	NC_010530	GAT	2	6	2398	2403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591850
46	NC_010530	GC	3	6	2468	2473	0 %	0 %	50 %	50 %	188591850
47	NC_010530	ATG	2	6	2495	2500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591850
48	NC_010530	TTGA	2	8	2519	2526	25 %	50 %	25 %	0 %	188591850
49	NC_010530	GGC	2	6	2583	2588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591851
50	NC_010530	ACGAT	2	10	2603	2612	40 %	20 %	20 %	20 %	188591851
51	NC_010530	CG	3	6	2622	2627	0 %	0 %	50 %	50 %	188591851
52	NC_010530	GGC	2	6	2634	2639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591851
53	NC_010530	TGC	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591851
54	NC_010530	G	6	6	2675	2680	0 %	0 %	100 %	0 %	188591851
55	NC_010530	ACG	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591851
56	NC_010530	GC	3	6	2788	2793	0 %	0 %	50 %	50 %	188591851
57	NC_010530	GTG	2	6	2812	2817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591851
58	NC_010530	GC	3	6	2823	2828	0 %	0 %	50 %	50 %	188591851
59	NC_010530	CACG	2	8	2841	2848	25 %	0 %	25 %	50 %	188591851
60	NC_010530	AGA	2	6	2852	2857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591851
61	NC_010530	CCG	2	6	2942	2947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591851
62	NC_010530	TCG	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591851
63	NC_010530	AGC	2	6	3026	3031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591851
64	NC_010530	GCT	2	6	3075	3080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591851
65	NC_010530	GAAG	2	8	3099	3106	50 %	0 %	50 %	0 %	188591851
66	NC_010530	CGG	2	6	3134	3139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591851
67	NC_010530	TGC	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591851
68	NC_010530	CGGA	2	8	3291	3298	25 %	0 %	50 %	25 %	188591851
69	NC_010530	ACG	2	6	3305	3310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591851
70	NC_010530	AGG	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591851
71	NC_010530	GCC	2	6	3386	3391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591851
72	NC_010530	GC	3	6	3490	3495	0 %	0 %	50 %	50 %	188591851
73	NC_010530	TATT	2	8	3651	3658	25 %	75 %	0 %	0 %	188591852
74	NC_010530	GGC	2	6	3730	3735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591852
75	NC_010530	CG	3	6	3784	3789	0 %	0 %	50 %	50 %	188591852
76	NC_010530	GCG	2	6	3793	3798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591852
77	NC_010530	GC	3	6	3800	3805	0 %	0 %	50 %	50 %	188591852
78	NC_010530	GCG	2	6	3813	3818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591852
79	NC_010530	CAGG	2	8	3835	3842	25 %	0 %	50 %	25 %	188591852
80	NC_010530	GC	3	6	3892	3897	0 %	0 %	50 %	50 %	188591852
81	NC_010530	CCACG	2	10	3948	3957	20 %	0 %	20 %	60 %	188591852
82	NC_010530	TGC	2	6	3981	3986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591852
83	NC_010530	CTCG	2	8	4053	4060	0 %	25 %	25 %	50 %	188591852
84	NC_010530	CAG	2	6	4066	4071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591852
85	NC_010530	GGC	2	6	4075	4080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591852
86	NC_010530	GCGCG	2	10	4083	4092	0 %	0 %	60 %	40 %	188591852
87	NC_010530	GCC	2	6	4124	4129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591852
88	NC_010530	GGC	2	6	4144	4149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591852
89	NC_010530	GTC	2	6	4156	4161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591852
90	NC_010530	GCG	2	6	4167	4172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591852
91	NC_010530	CG	3	6	4171	4176	0 %	0 %	50 %	50 %	188591852
92	NC_010530	GC	3	6	4237	4242	0 %	0 %	50 %	50 %	188591852
93	NC_010530	CAGC	2	8	4284	4291	25 %	0 %	25 %	50 %	188591852
94	NC_010530	GCTG	2	8	4308	4315	0 %	25 %	50 %	25 %	188591852
95	NC_010530	GC	3	6	4326	4331	0 %	0 %	50 %	50 %	188591852
96	NC_010530	GCC	2	6	4341	4346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591852
97	NC_010530	GC	4	8	4365	4372	0 %	0 %	50 %	50 %	188591852
98	NC_010530	GTC	2	6	4432	4437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591852
99	NC_010530	TTG	2	6	4460	4465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591852
100	NC_010530	GCC	2	6	4475	4480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591852
101	NC_010530	CAG	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591852
102	NC_010530	CCT	2	6	4500	4505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591852
103	NC_010530	TGC	2	6	4524	4529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591852
104	NC_010530	CGGC	2	8	4532	4539	0 %	0 %	50 %	50 %	188591852
105	NC_010530	ACC	2	6	4565	4570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591852
106	NC_010530	GCC	2	6	4597	4602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591852
107	NC_010530	CGG	2	6	4608	4613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591852
108	NC_010530	GCG	2	6	4683	4688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591852
109	NC_010530	CG	3	6	4687	4692	0 %	0 %	50 %	50 %	188591852
110	NC_010530	GCA	2	6	4710	4715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591852
111	NC_010530	GCG	2	6	4716	4721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591852
112	NC_010530	CCA	2	6	4813	4818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591852
113	NC_010530	GGGC	2	8	4896	4903	0 %	0 %	75 %	25 %	188591852
114	NC_010530	TGCTGG	2	12	4925	4936	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	188591852
115	NC_010530	GCC	2	6	4940	4945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591852
116	NC_010530	CGG	2	6	4982	4987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591852
117	NC_010530	GGCC	2	8	5013	5020	0 %	0 %	50 %	50 %	188591852
118	NC_010530	GC	3	6	5042	5047	0 %	0 %	50 %	50 %	188591852
119	NC_010530	CAG	2	6	5089	5094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591852
120	NC_010530	CGT	4	12	5121	5132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591852
121	NC_010530	GTC	2	6	5137	5142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591852
122	NC_010530	ACC	2	6	5159	5164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591852
123	NC_010530	GGC	2	6	5167	5172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591852
124	NC_010530	GCAC	2	8	5192	5199	25 %	0 %	25 %	50 %	188591852
125	NC_010530	GGC	2	6	5200	5205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591852
126	NC_010530	ATC	2	6	5246	5251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591852
127	NC_010530	CCA	2	6	5784	5789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591853
128	NC_010530	TTGA	2	8	5795	5802	25 %	50 %	25 %	0 %	188591853
129	NC_010530	CCT	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591853
130	NC_010530	CTG	2	6	5837	5842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591853
131	NC_010530	GCCG	2	8	5944	5951	0 %	0 %	50 %	50 %	188591853
132	NC_010530	GT	3	6	5984	5989	0 %	50 %	50 %	0 %	188591853
133	NC_010530	GCG	2	6	6116	6121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591853
134	NC_010530	CGG	2	6	6139	6144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591853
135	NC_010530	GCCGG	2	10	6175	6184	0 %	0 %	60 %	40 %	188591853
136	NC_010530	CGG	2	6	6231	6236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591853
137	NC_010530	GTG	2	6	6248	6253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591853
138	NC_010530	GCCA	2	8	6275	6282	25 %	0 %	25 %	50 %	188591853
139	NC_010530	GCG	2	6	6290	6295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591853
140	NC_010530	GGT	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591853
141	NC_010530	CGGC	2	8	6348	6355	0 %	0 %	50 %	50 %	188591853
142	NC_010530	CTG	2	6	6362	6367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591853
143	NC_010530	CAA	2	6	6508	6513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591853
144	NC_010530	GCC	2	6	6583	6588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591853
145	NC_010530	ACCT	2	8	6897	6904	25 %	25 %	0 %	50 %	188591854
146	NC_010530	AATGA	2	10	6915	6924	60 %	20 %	20 %	0 %	188591854
147	NC_010530	CGC	2	6	6988	6993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591854
148	NC_010530	GC	5	10	7011	7020	0 %	0 %	50 %	50 %	188591854
149	NC_010530	CTG	2	6	7027	7032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591854
150	NC_010530	GC	4	8	7086	7093	0 %	0 %	50 %	50 %	188591854
151	NC_010530	CGC	3	9	7091	7099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591854
152	NC_010530	CGC	2	6	7102	7107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591854
153	NC_010530	CG	3	6	7159	7164	0 %	0 %	50 %	50 %	188591854
154	NC_010530	CG	3	6	7184	7189	0 %	0 %	50 %	50 %	188591854
155	NC_010530	GCTG	2	8	7204	7211	0 %	25 %	50 %	25 %	188591854
156	NC_010530	GCT	2	6	7256	7261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591854
157	NC_010530	CGG	3	9	7291	7299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591854
158	NC_010530	GGC	2	6	7335	7340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591854
159	NC_010530	CCCT	2	8	7392	7399	0 %	25 %	0 %	75 %	188591854
160	NC_010530	ACC	2	6	7422	7427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591854
161	NC_010530	TCG	2	6	7551	7556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591855
162	NC_010530	TGC	2	6	7598	7603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591855
163	NC_010530	GCC	2	6	7619	7624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591855
164	NC_010530	CAT	2	6	7625	7630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591855
165	NC_010530	GCG	2	6	7641	7646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591855
166	NC_010530	GCT	2	6	7675	7680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591855
167	NC_010530	GCC	3	9	7724	7732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591855
168	NC_010530	CG	5	10	7738	7747	0 %	0 %	50 %	50 %	188591855
169	NC_010530	TGC	2	6	7767	7772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591855
170	NC_010530	ATC	2	6	7796	7801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591855
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172	NC_010530	GCC	2	6	7822	7827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591855
173	NC_010530	GCA	2	6	7858	7863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591856
174	NC_010530	CTG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591856
175	NC_010530	ACGCG	2	10	8015	8024	20 %	0 %	40 %	40 %	188591856
176	NC_010530	CGGC	2	8	8029	8036	0 %	0 %	50 %	50 %	188591856
177	NC_010530	A	7	7	8037	8043	100 %	0 %	0 %	0 %	188591856
178	NC_010530	CCG	2	6	8049	8054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591856
179	NC_010530	CTG	2	6	8372	8377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591857
180	NC_010530	GGCGC	2	10	8412	8421	0 %	0 %	60 %	40 %	188591857
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182	NC_010530	GTG	2	6	8444	8449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591857
183	NC_010530	CGC	2	6	8455	8460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591857
184	NC_010530	GCT	2	6	8467	8472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591857
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189	NC_010530	GCCG	2	8	8599	8606	0 %	0 %	50 %	50 %	188591857
190	NC_010530	GGC	3	9	8610	8618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591857
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193	NC_010530	GGCG	2	8	8710	8717	0 %	0 %	75 %	25 %	188591857
194	NC_010530	GCG	2	6	8758	8763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591857
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200	NC_010530	CTG	2	6	8986	8991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591857
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209	NC_010530	GCTG	2	8	9499	9506	0 %	25 %	50 %	25 %	188591858
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244	NC_010530	CCG	2	6	11330	11335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591860
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249	NC_010530	GTG	2	6	11394	11399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591860
250	NC_010530	GCCG	2	8	11405	11412	0 %	0 %	50 %	50 %	188591860
251	NC_010530	CG	3	6	11438	11443	0 %	0 %	50 %	50 %	188591860
252	NC_010530	GGA	2	6	11459	11464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591860
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255	NC_010530	TTC	2	6	11673	11678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591860
256	NC_010530	GCT	2	6	11735	11740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591860
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258	NC_010530	TGGCGC	2	12	11884	11895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	188591860
259	NC_010530	TGC	2	6	11896	11901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591860
260	NC_010530	CCA	2	6	11903	11908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591860
261	NC_010530	CGG	2	6	12017	12022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591861
262	NC_010530	GCT	2	6	12071	12076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591861
263	NC_010530	CACG	2	8	12200	12207	25 %	0 %	25 %	50 %	188591861
264	NC_010530	CG	4	8	12254	12261	0 %	0 %	50 %	50 %	188591861
265	NC_010530	GTG	2	6	12267	12272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591861
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393	NC_010530	ATC	2	6	17286	17291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591865
394	NC_010530	GAC	2	6	17322	17327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591865
395	NC_010530	CGC	2	6	17514	17519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591866
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397	NC_010530	CG	4	8	17533	17540	0 %	0 %	50 %	50 %	188591866
398	NC_010530	GCC	2	6	17570	17575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591866
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495	NC_010530	ACG	2	6	20834	20839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591867
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499	NC_010530	GCA	2	6	21002	21007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591867
500	NC_010530	GC	5	10	21072	21081	0 %	0 %	50 %	50 %	188591867

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